アップグレードしたもののいろんなところがおかしくなり直すの大変でした。
バックアップしたデータベースのdumpファイルをまとめてアップすると容量大きすぎで途中で止まってしまうので複数に分けて実行。しかもエンコーディング間違えまくって何回もするハメに・・・
んで、データベースの復旧ができたと思えばこんどはアーカイブの出力ファイル名の設定が全部飛んでたよ・・。データベースにも残ってないし・・・

ファイル名変わるのはどうしても避けたかったので何とか調べて元の設定に戻しました。
個別エントリーアーカイブ：<$MTEntryID pad="1"$>.shtml
月別アーカイブ：<MTDate format="%Y_%m">.shtml
カテゴリーアーカイブ：cat_<$MTCategoryID$>.shtml

まぁ入れっぱなしで使わなくなったプラグインも削除したし結構リフレッシュしたかな。
残したプラグイン：
MTTagInvoke.pl
mt-pingedentry.pl
otherblog.pl